Al piano interrato della Galleria Pizzinato si trova il caveau del museo: un archivio climatizzato e protetto da sistemi di sicurezza, progettato per la conservazione delle opere più delicate. È organizzato in due stanze — una di consultazione e una di conservazione — entrambe mantenute a temperatura costante (16°C) e umidità controllata.
Qui sono custodite tavole originali, oggetti e pubblicazioni storiche che raccontano il fumetto in tutte le sue forme. Le collezioni dell’International Museum of Comic Art sono infatti esposte solo in parte nelle sale di Villa Galvani: il patrimonio complessivo supera le 200 tavole originali e vanta oltre 1500 tra riviste e oggetti, provenienti da acquisizioni, donazioni e prestiti da tutto il mondo.
Tra i pezzi più preziosi figurano una strip di Charles M. Schulz, due tavole originali di Will Eisner e una tavola di George McManus. Molti di questi tesori sono conservati proprio qui, in uno spazio accessibile su richiesta, che garantisce le condizioni necessarie alla loro tutela e favorisce nuove donazioni da parte di collezionisti italiani e internazionali.